在处理论文引用文献在知网查重时，首先要确保引文格式准确无误，包括作者、题目、期刊、年份等信息。其次，可以适当增加自己的研究成果，减少引用内容，以降低重复率。另外，使用知网查重工具前，可以先进行本地查重，确保论文原创性。最后，及时修改和调整引文，避免与他人重复，提高论文质量。

处理论文引用文献在知网查重问题时，需要注意避免直接复制粘贴他人的引文，应该根据自己的研究内容进行合理引用，并注明出处。此外，可以通过修改引文的表达方式、调整语句结构等方法，使得引文更符合自己的论文风格，减少重复度。同时，可以参考知网查重报告，对重复部分进行适当修改，确保论文通过查重。